تتمثل مهام إمارة منطقة المدينة المنورة في النقاط التالية:

• تمثيل خادم الحرمين الشريفين في المنطقة.
• التأكد من تحقيق سير العدالة في المنطقة.
• العمل على حفظ الأمن في المنطقة.
• العمل على توفير كافة الخدمات لمواطني المنطقة بالتعاون والتنسيق مع الجهات الحكومية والمشاركة في مراحل التخطيط لكافة الخدمات.
• التأكد من كفاءة وفاعلية الخدمات التي تقدم لمواطني المنطقة، والعمل على تحسين وتطوير تقديم تلك الخدمات.
• تلقي شكاوى واستدعاءات المواطنين والنظر في أمورهم والعمل على تلبية مطالبهم وحل مشكلاتهم.